L'association est composée de membres titulaires et de membres suppléants. Les membres titulaires sont les présidents et les 2ièmes vice-présidents des sections du CNU. Les membres suppléants sont respectivement les 1ers vice-présidents et les assesseurs des sections du CNU. Les membres suppléants siègent en cas d'empêchement de leurs titulaires. La Conférence des sections médicales du CNU est représentée dans l'association par deux de ses membres désignés par son bureau.
